1. 開機時如出現超壓報警“Plunger homing over pressure ”時，常見原因是泵頭位置的在線過濾器堵塞。可將過濾器內過濾芯取出，依次使用 純水----純甲醇----異丙醇---稀硝酸（30%） 超聲清洗30min，一般可以清洗掉污染物，如反復清洗無效，則需要更換過濾芯。
2. 系統運行時出現“Lost Prime”, 意思是系統壓力太低，低于正常液相工作需要的反壓，此時多數是泵頭單向閥污染，或有小氣泡殘留在閥體內，輸液不暢所致，可以通過“Wet Prime”操作5分鐘，嘗試沖洗出氣泡，如此操作無效，則需要把單向閥取下，單超聲清洗。依次使用 純水----純甲醇----異丙醇---稀硝酸（30%） 超聲清洗30min。
3. 當發現系統壓力波動較大時（尚下壓力波動超過100甚至2、300psi時），是泵頭或者單向閥內有氣泡，可使用“Wet Prime” 操作5~10分鐘，用大流速的方法把氣泡沖洗出來。
如以上操作不能奏效，則需要取出單向閥，按照上文 2 中內容清洗。多次清洗仍不奏效，需要更換單向閥。
4. 如出現系統進樣重現性有問題時，
先觀察保留時間情況，如保留時間有問題，則主要查看系統壓力波動是否正常，正常使用時，1ml/min流速下，儀器的系統壓力在2000~3000psi之間（依不同的色譜柱和不同的流動相種類，比例有差異），但是壓力波動應該在50psi之內方算正常，平衡良好的系統壓力波動可以在10psi之內。如果壓力波動過大，則考慮單向閥有污染或者氣泡，需要進行處理。
如果保留時間基本正常，而峰面積差異很大，則考慮進樣器系統的問題，打開進樣器側門，觀察注射器內是否有氣泡，如有，通過Purge Inject 操作排除氣泡。（注意：儀器右側的syringe不能有氣泡，一旦出現氣泡，請使用面板上的purge injector功能）
5．2690/2695的單向閥與某些品牌的乙腈存在兼容性的問題，具體情況是：當使用100%乙腈后，放置一晚，第二天繼續開機實驗時，會出現泵不出液的現象，原因是單向閥在純乙腈浸泡后，會導致閥體與寶石球吸住的情況，此時必須把單向閥取出，輕輕敲擊，用手搖動時，耳邊可以聽到輕微聲音，這時單向閥即恢復正常，將其裝回原處，Wet Prime 5分鐘，即可正常實驗。
為避免這種問題的出現，建議用戶在設置梯度或重新色譜柱時，在zui后階段不要使用100%的乙腈，可以設置成95%的乙腈，則問題就不會發生。或者將乙腈流路的溶劑瓶中的乙腈直接配成95%或98%的乙腈。避免純乙腈導致的單向閥吸住的問題。
6.996/2996 PDA 檢測器 一般無特殊操作。常見故障有
A．Lamp 燈閃爍 ， 提示燈無法點亮，需要更換新燈。
B．Status 燈閃爍，一般提示光路有問題，常見原因是流通池被樣品污染或者流通池內有氣泡，可用純甲醇沖洗30分鐘，一般即可恢復正常。
使用注意事項：
1.使用過含鹽流動相后，必須先用純水相沖洗系統足夠時間，然后在轉為有機相保存，切不可直接用有機相沖洗系統。
2.2690/2695 單元具有自動清洗泵密封圈的功能，請務必保證密封圈清洗液瓶SEAL WASH中有足夠的液體，一般使用5:95的甲醇：水或者5:95的異丙醇：水(加入5%~10%有機相的目的是為避免溶液長菌)。
3.2690/2695 單元具有每次進樣前自動清洗進樣針的功能，請務必保證進樣針清洗液瓶NEEDLE WASH中有足夠的液體（綠色管路的瓶中）。一般清洗液可以選擇90:10的甲醇：水。如果在殘留測試時發現進樣有殘留，可以調整清洗液的種類及在儀器方法中設定增強清洗的功能。
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